איכות אוויר טובה מאוד נרשמה ביום הכיפורים ברוב תחנות הניטור של המערך הארצי לניטור אוויר, המפוקח על-ידי המשרד להגנת הסביבה.
עם כניסת החג ירדו באופן דרסטי ריכוזי תחמוצות החנקן, המהווים סמן לזיהום אוויר מכלי רכב, בתחנות התחבורתיות בחיפה, בגוש דן ובירושלים. ריכוזי תחמוצות החנקן ביום הכיפורים בתחנות התחבורתיות בערים הגדולות עמדו על ערכים שבין 0.6 ל-13.7 חלקים לביליון (חל"ב), פרט לתחנה בדרך ז'בוטינסקי בבני ברק שבה ב-1:00 בלילה נרשם ריכוז של 20.7 חל"ב.
לשם השוואה, בערב יום כיפור בשעות הבוקר הגיעו הריכוזים במרכז ת"א (רחוב אלנבי) עד ל-121.5 חלקים לביליון; ובמרכז ירושלים נרשמו ריכוזים של עד 73.5 חלקים לביליון. נציין, כי בחיפה תחתית ריכוזי תחמוצות חנקן ירדו מ-87.7 חל"ב ל-1.8 חל"ב ביום הכיפורים. גם ריכוזי הבנזן שמקורם מתחבורה ירדו מ-0.85 חל"ב בערב יום הכיפורים בשעות הבוקר ל-0.04 חל"ב ביום הכיפורים.
השיפור המשמעותי באיכות האוויר ביום הכיפורים מדגים את ההשפעה של התחבורה כמקור העיקרי לזיהום האוויר במרכזי הערים הגדולות. נדגיש, כי הירידה הדרסטית חלה רק בתחמוצות חנקן ולא בחלקיקים העוברים בדרכי הנשימה או במזהמים שניוניים. לחלקיקים הנשימים, יש זמן שהות ארוך באטמוספירה (כ-10 ימים) עד לסילוקם, ומזהמים שניוניים משתתפים בתהליכים פוטוכימיים מורכבים.
ככלל, תחמוצות החנקן גורמת לסימפטומים שונים של מחלות בדרכי הנשימה ולהקטנת עמידות הגוף בפני חיידקים. חשיפה לריכוזים גבוהים מאד של חנקן דו-חמצני, המזהם המזיק לבריאות בתוך תחמוצות החנקן, עלולה לגרום להגברה של תגובות דלקתיות במערכת הנשימה של אנשים בריאים, בקרב חולי מחלת נשימה כרונית COPD (Chronic Obstructive Pulmonary Disease) וכן בקרב חולי אסתמה ומעלה את תדירות הסימפטומים הנשימתיים (התקפים).
