מיד עם פרסום חשיפת המנהרה, הוטל בישראל האחריות לחפירת המנהרה על חמאס. גורם ישראלי אמר אז כי "צה"ל מטיל את האחריות על ארגון חמאס, משום שהארגון אחראי לכל מה שמתרחש ברצועה".
במהלך סריקות שביצעה צה"ל לאורך גדר המערכת, פוצצו הפלסטינים מנהרת תופת ע"י שלט רחוק. כתוצאה מהפיצוץ נפגע חייל צה"ל באורח קל מאוד. ונזק נגרם לרכב צבאי. לפי הערכות - נמנע פיגוע