תצהירו הנגדי של ראש הממשלה בנימין נתניהו לבג"ץ עורר גל תגובות חריפות מצד שרים ואישי ציבור. שר החינוך יואב קיש תקף בחריפות את ראש השב"כ המפוטר רונן בר: "ראש הממשלה הניח בתצהירו לבג"צ כתב אישום חמור מאין כמותו. השקרים של בר בתצהירו, נסיונות ההטעיה והרמיה שלו את שופטי בג"צ ואת הציבור הישראלי, לא יסולחו".
קיש הוסיף כי "התנהלות רונן בר היא סכנה ברורה לבטחון מדינת ישראל", וציין שהממשלה אישרה היום שוב את פיטוריו. "בג"צ חייב להורות מיידית על פיטוריו של בר, אין שום דרך אחרת", הדגיש השר.
השר לביטחון לאומי איתמר בן גביר הצטרף לביקורת: "רונן בר, שקרן. אמרתי כבר לפני שנה וחצי שצריך להעיף אותו, חבל שלא שמעו לי. עדיף מאוחר מאשר לא. רונן בר הביתה. עכשיו!"
מנגד, יונתן שמריז, אח של אלון ז"ל ומייסד תנועת "קומו", ביקר את התצהיר מכיוון אחר: "שני דברים בוודאות חסרים בתצהיר רוה"מ: לקיחת אחריות ובקשת התנצלות על גיבוש קונספציית חמאס הוא נכס, ותאריך להקמת ועדת חקירה ממלכתית".
שמריז הדגיש: "שני הדברים הללו עוד יקרו. ועדת חקירה ממלכתית תוקם והאחראים לאסון לא יצליחו לחמוק מאחריותם".
התגובות החריפות מדגישות את העימות הגובר בין ראש הממשלה לראש השב"כ המפוטר, ומעלות שאלות לגבי השלכות המשבר על יחסי הממשלה עם מערכת הביטחון.
נתניהו משקר כמו שהוא נושם , מייד להכניסו לכלא על בגידה במדינה
לא צריך לריב, שניכם אשמים שניכם תלכו הביתה