מבקר המדינה מתניהו אנגלמן מאשים את ראש הממשלה ומנכ"ל משרדו לשעבר יוסי שלי בטיפול הממשלתי הלקוי ביישובי הצפון בזמן המלחמה: "העיכוב המתמשך בגיבוש מדיניות ממשלתית לטיפול בתושבי הצפון בזמן המלחמה, הוא ליקוי יסודי בטיפול הממשלה, הליקוי הזה מונח לפתחם של משרד ראש הממשלה, והעומד בראשו, ראש הממשלה בנימין נתניהו, ומנכ"ל המשרד לשעבר, יוסי שלי. הם לא ביצעו את המשימות המרכזיות שהוטלו על משרד ראש הממשלה בהחלטת ממשלה". זה הביקורת המשמעותיות ביותר בדו"ח מבקר המדינה, מתניהו אנגלמן, על הטיפול הממשלתי ביישובי הצפון בזמן המלחמה.
הדו"ח מביא ממצאים שמלמדים על כך שמצבם של תושבי הצפון רחוק מלהיות מיטבי. קשה כמובן לקשור באופן סיבתי בין "כינוס ועדת השרים" לבין מה שהיה קורה בשטח, אך יש מקום להניח שאם הממשלה היתה מאורגנת יותר הנתונים היו חיוביים יותר.
הנתון הדרמטי ביותר הוא שבספטמבר 2024 רק 24% מתושבי הצפון אמרו שחזרו לביתם או יחזרו בוודאות. זאת לעומת 54% ממפוני הדרום. 54% ממפוני הצפון השיבו כי יש סיכוי גבוה שהם יעזבו את מקום מגוריהם, לעומת 13% בלבד ממפוני הדרום. החלק הקשה אף יותר הוא ששיעור הסבורים שלא יחזרו לצפון גבוה בהרבה דווקא בקרב הצעירים והמשכילים. נתונים נוספים הם, שכ-54% מאלו שהתפנו באופן עצמאי מגלים תסמינים של פוסט טראומה. כחצי מההורים של תלמידי תיכון בצפון דיווח על פגיעה בציונים. כ-27.3% מהעסקים העצמאיים שוקלים שלא להמשיך לפעול בצפון.
ביישובי הצפון מתחו ביקורת חריפה על הממשלה,. משה דוידוביץ, ראש המועצה האזורית מטה אשר, אמר כי "הדוח חמור מאוד, ואין ספק שתושבי קו העימות בפרט והצפון בכלל הופקרו. השר הממונה אלקין, האחראי על מנהלת הצפון, חייב לתושבים שלנו תשובות". ראש המועצה האזורית הגליל העליון, אסף לנגלבן, הוסיף: "צה"ל עושה לילות כימים למען ביטחון תושבי הצפון, ממשלת ישראל ויתרה על הגליל העליון ללא קרב".
