מקורות בחמאס ובארגוני הטרור הפלסטיניים סיפרו לעיתון הסעודי "א-שרק אל-אווסט" כי ימים ספורים לאחר מתקפת 7 באוקטובר, הנהגת הזרוע הצבאית של חמאס קיימה קשרים ישירים ועקיפים עם מפקדי שטח בארגוני טרור נוספים שהחזיקו חטופים ישראלים. על פי הדיווח, החטופים זוהו, מוספרו וחולקו בין הארגונים – חלקם הועברו לאחר מכן לידי חמאס, ואחרים נותרו בידי הג'יהאד האסלאמי ופלגים נוספים.
לדברי המקורות, במקרים מסוימים כוחות צה"ל הגיעו למרחק של מטרים ספורים בלבד מחלק מהחטופים, אך האחראים על שמירתם הצליחו להטעות את הכוחות ולמנוע את איתורם או חילוצם. בין היתר נטען כי חטופים הוסתרו במנהרות תת-קרקעיות שנחפרו מתחת לעמדות ישראליות, מבלי שהדבר התגלה.
עוד דווח כי הנהגת הזרוע הצבאית של חמאס התמקדה באופן שיטתי בסוגיית החזקת החטופים. לאחר הפסקת האש הראשונה בנובמבר 2023 התקיימו פגישות פנים אל פנים עם מנהיגים צבאיים מארגוני טרור אחרים, במטרה להסדיר את ניהול החטופים, למפות מי מהם בחיים ומי נהרגו, ולהעביר חטופים נוספים לשליטת חמאס.
על פי הדיווח, במהלך הפסקת האש שהושגה בינואר 2025 ננקטו אמצעי תיאום רחבים בין הזרוע הצבאית של חמאס, הג'יהאד האסלאמי ופלגים נוספים. צוין כי לא רק יחידת "הצללים" של חמאס עסקה באבטחת החטופים, אלא גם יחידות אחרות שסיפקו סיוע לוגיסטי ואבטחתי.
עוד נמסר כי חטופים רבים הועברו מצפון רצועת עזה לדרומה תחת אבטחה הדוקה, כחלק מהיערכות כוללת למניעת גילויים על ידי כוחות צה"ל במהלך הלחימה.
