כמיטב המסורת מכירת הדלקות נרות חנוכה של כלל הימים נערכת ע"י משגיח הישיבה הגאון רבי אליהו אהרון שליט"א בליל נר ראשון, כאשר נוהגים שההדלקות בלילה נמכרים בדפי גמרא, וההדלקות בבוקר נמכרים ע"י סימנים של משנ"ב, וזאת כדי לעודד את לימוד ההלכה בישיבה. באחד מהימים קנה אחד הבחורים את זכות ההדלקה באלף חמש מאות דפי גמרא וכיבד את רה"י הגר"ח כהן בהדלקה.
לאחר מעמד ההדלקה מתקיימת תפילת ערבית כאשר לאחריה פוצחים הבחורים בריקוד מיוחד בהודאה לבורא עולם.
יצויין שבפתח הישיבה מוצבת עמדה להדלקת נרות חנוכה עבור בני הישיבה שנוהגים להדליק את הנרות ללא ברכה, כמו"כ לפני ההדלקה יוצאים הבחורים להיטהר במקווה טהרה סמוך כמנהג ישראל קדושים…
ביום שני בערב נערכה בישיבה מסיבת חנוכה לבחורים בחדר האוכל בהשתתפות כלל רבני הישיבה ובהשתתפות נשיא המוסדות הגה"צ רבי יהודה כהן שליט"א חבר מועצת חכמי התורה, אשר חיזק את הבחורים במעלת ריבוי הקדושה בימים אלו ושמירת פך השמן הטהור והחובה הגדולה להרבות בלימוד תורה בימים אלו.
לאחמ"כ רה"י הגר"ח כהן נשא דברים לבחורים, בדבריו חיזק ועודד את מעלת סדר ד' בישיבה, ובדבריו צין לבחורים "שכול מעלת חנוכה היא תוספת לימוד תורה".
כמו"כ הגאון רבי עזרא בן שמעון שליט"א מרבני הישיבה נשא דברים בענייני השעה על רדיפת לומדי התורה, "שכמו שהשמן שככל שנכתש יותר – כך יוצא הטוב שבו, כך בני התורה למרות הרדיפות והביזיונות אדרבה זה רק גורם לנו להתחזק ולהאיר יותר".
לסיום נערך זיץ מסורתי בהשתתפות כלל בחורי הישיבה ובוגריה כאשר את הזיץ עורך כמיטב המסורת ראש הישיבה הגר"ח כהן שהעביר במהלך הזיץ מסר בדבריו על נושא ההתרחקות מן העמים, "כל המסר של חג החנוכה מבוסס על התבדלות מן העמים, שלזה זוכים רק ע"י קדושת הפה וצורת ההתנהגות של בני תורה, והרווח העצום שזוכים מכך", את דבריו טיבל רה"י הגר"ח בסיפורים מופלאים על גדולי הדורות זיע"א.
יצוין שנערכו זיצים מחזקים דומים מאת ראש הישיבה גם בסניפי הישיבה בחזון יחזקאל ובאופקים.
