עם פריחת עולם התורה בשנים האחרונות, הלחץ גובר בישיבה מידי שנה לקבלת תלמידים נוספים הרוצים להתקבל לישיבה, הבחורים עוברים מבחנים אצל כל צוות הישיבה שלאחר מכן מתקיימת אסיפת צוות בבית ראש הישיבה שליט"א שם נופלת ההכרעה הסופית על כל בחור ובחור.
עם גידול התלמידים המתמשך בישיבה, בני שיעור א' מתחלקים לשני שיעורים, שאותם שומעים מהמגידי שיעורים אשר נודע שמם הגאון רבי אהרן דוד מלאכי שליט"א והגאון רבי אהרן יוסף קלרנשטיין שליט"א, שבכל שיעור נמנים 96 בחורים.
בני שיעור ב' מתחלקים אף הם לשני שיעורים, הנמסרים ע"י הרמי"ם הותיקים אשר פקיע שמם בלמדנותם הגאון רבי חנוך הבלין שליט"א והגאון רבי מיכאל קופמן שליט"א בעל ה'בית האוצר' על התלמוד. שבכל שיעור כ-90 בחורים.
לבני שיעור ג' מוסר את השיעורים היומיים מרן ראש הישיבה הגר"ש מרקוביץ שליט"א ובהמשך השנה מוסר מרן הגרי"מ הלוי דזי'מיטרובסקי שליט"א בעל ה'מילואים' ומראשי הישיבה.
מידי יום ראשון נמסר ה'שיעור כללי' המפורסם מראש ישיבת פוניבז' שליט"א בהשתתפות כלל בני הישיבה, וקבוצת תלמידי חכמים בוגרי הישיבה שבאים לשמוע מידי שבוע לשמוע את השיעור.
ביום שני בערב מוסר מרן המשגיח הגה"צ רבי אליהו אליעזר דסלר שליט"א את השיחה השבועית לבני הישיבה, מלבד הוועדים מידי יום לבני השיעורים.
במהלך השבוע נמסרים גם חבורות קבועות לכלל בני הישיבה, שתי חבורות ע"י הגרי"מ הלוי דזימיטרובסקי שליט"א, חבורה מהגר"י זלושינסקי שליט"א, חבורה מהגר"ח הבלין שליט"א וחבורה מהגר"מ קופמן שליט"א, החבורות נמסרים בשעות הערב בחדרי השיעורים וחדר האוכל 'אשל יפה'.
האוירה השנה עם תחילת אלול הורגשה באופן מיוחד לאור קריאת מרן ראש הישיבה שליט"א להחזיר עטרה ליושנה וללמוד פרק 'תמיד נשחט'. ולהספיק בשלושת הסדרים במהלך היום כמה שיותר נושאים וסוגיות בקדשים בעיון. וכן בסדרים המיוחדים בימי שישי ושבת. יצויין, כי בעולם הישיבות ישנם שלא מרבים ללמוד סוגיות אלו לאור קושיים חריפותם ועמקם של הסוגיות.
מעניין לציין, כי בישיבה משיעור ג' ומעלה מתקיים עדיין הנוהג הקבוע של מסירת חבורות לחברי החדר בחדרי הפנימיה על הסוגיות הנלמדות בהשתתפות רבני הישיבה וראש הישיבה שבאים לשמוע את התלמידים, מהלך שיסד ראש ישיבת פוניבז' לפני מספר שנים בישיבה וצובר תאוצה ומחזק את שינון הסוגיות גם בחדרי הפנימיה.
