במהלך שנות ההנהגה של מרן ראש הישיבה חכם שלום כהן זצוק"ל נרשמו אירועים חריגים שעוררו תהודה או סערה בכלי התקשורת. אחד הרגעים שנחקקו בזיכרונם של רבים, הוא המשא המרכזי של נשיא מועצת חכמי התורה במהלך מעמד 'הקבלת פני רבו' בחג הסוכות בשנת תש"פ.
במעמד הגדול, בהשתתפות מרנן ורבנן חברי מועצת חכמי התורה, התייחס מרן ראש הישיבה זצ"ל לניסיונות של יאיר לפיד ואביגדור ליברמן להקים ממשלה ללא החרדים. ניסיון שלא צלח אז.
נשיא המועצת נקט אז במילים חריגות שעוררו הדים רבים: "אני מדבר אליכם, ליברמן ולפיד – תדעו לכם שאני לא שונא אף אחד. עובדה. אם תבואו מחר לבית הכנסת, כשאני מברך את עם ישראל, אני אברך אתכם באהבה. ותדעו לכם שאני יום-יום מתפלל עליכם".
"החזון איש אומר: 'תדע לך שכל הפושעים של היום, הם לא פושעים –הם תינוקות שנשבו'. את מי הם רוצים להרגיז?" שאל נשיא המועצת ופנה ליו"ר ש"ס אריה דרעי שישב לצידו: "אותך אריה, או את הקדוש ברוך הוא?" דרעי השיב: "אותי", וראש הישיבה המשיך: "זה הכול. אלה הם מסכנים, תינוקות שנשבו. ואני רוצה להוכיח לכם שהקדוש ברוך הוא אוהב אתכם, וההוכחה היא שהוא לא נתן לכם להקים ממשלה רעה".
בהמשך אמר: "אני אומר עכשיו ללפיד וליברמן – אם עכשיו תצטרפו לממשלה עם החרדים תזכו לבת קול שתצא ותכריז: 'ליברמן ולפיד מוזמנים לחיי העולם הבא'. תוכלו לקנות את עולמכם בשעה אחת".
אבידה גדולה
ממש אבידה הרב היחיד לדעתי שיורד מרום דרגתו רקכדי לעודד את עם ישראל הפשוטים
אנשי אמונה אבדו
קודש קודשים!
הפסד ענק לעם ישראל
אנא ה’ תמהר להביא את הגאולה
עצוב וכואב בלב
לא חסר דברים שחכם שלום היה בהם גדול אבל משאניאך ה' אשנא בלי לחלוק על הרב ח"ו ואין לדעת מה היו חשבונותיו