הוא היה אחד מחשובי האברכים בכולל של מרן הגאון הגדול רבי אביגדור נבנצל שליט"א. הרב שמואל אטלן, עלה ארצה מצרפת כדי ללמוד מתורת ארץ ישראל, מתוך הדחק. גם בחודשי מחלתו, לא וויתר והגיע במסירות נפש ללמוד וללמד, לשמור ולעשות.
אחרי פטירתו, יוצא מרן הגר"א נבנצל במכתב נדיר בכתב ידו, בו הוא מבקש מכל אחד ואחד לתרום עבור האלמנה והיתומים, חלקם כבר בגיל שידוכים, ולסייע להם כלכלית אחרי הטרגדיה הנוראה שנפלה עליהם.
"כאשר שמועה באה עם פטירת האברך החשוב הרב הגאון רבי שמואל אטלן זללה"ה אשר למד והרביץ תורה מתוך הדחק ובסוף ימיו מתוך יסורים קשים ומרים, והשאיר אלמנתו החשובה שתחי' עם שבעה יתומים שנותרו ללא משענת כספינה מטורפת בלב ים, והוצאות הקיום היום יומיות גדולות מאוד ונתעוררו הרבנים הגאונים החשובים של וועד הרבנים להקים להם קרן לתמוך בהם בצורה מכובדת בכל חודש, ולהשיא היתומים היקרים בעיתם ובזמנם".
מרן הגר"א נבנצל מתחנן: "מקרב לב תערב בקשתי מכל אחד ואחד להיות נושא בעול הקרן בהשתתפות של 50X250 שבזה זוכים להרנין לב האלמנה והיתומים ולהיות בסיס קבוע להחזקתם".
לסיום הוא מבטיח: "וכל העוזרים והמסייעים יתברכו בכל הברכות, בכלל, עם בני חיי ומזוני, ובכל אשר יפנו ישכילו ויצליחו, בפרט, ואביהם של יתומים ודיין אלמנות יברכם בעושר ואושר בעוה"ז והקרן קיימת לעוה"ב ולמלאות כל משאלות ליבם לטובה ולברכה, ולהקביל פני משיח צדקנו עכ"י בב"א".
